28 июня 2011 года полицейские остановили автомобиль, в котором был Эзра с 20 гр марихуаны. Его обвинили в хранении наркотиков, но вскоре обвинение сняли. Он был вынужден заплатить штраф в 600 долларов. Позже актёр признался, что не видит смысла скрывать, что курит марихуану, так как она безвредна.
Эзра барабанщик и вокалист в группе Sons of an Illustrious Father.
В 2012 году сделал каминг-аут и рассказал, что является квиром и пытался строить отношения как с парнями, так и с девушками. Также он заявляет, что отвергает гендерные идентификации и не собирается вешать на себя ярлыки, навязанные обществом.
Эзра Миллер родился в семье танцовщицы немецкого происхождения Марты Миллер (в девичестве Кох) и старшего вице-президента издательства Hyperion Books Роберта Миллера еврейского происхождения.
Полное имя — Эзра Мэттью Миллер (Ezra Matthew Miller).