В жилах Кирстен течет шведская и немецкая кровь.
Отец Кирстен, Клаус Данст, был служащим в медицинской компании. Инез Данст, её мать, была художницей, а также создателем и владельцем художественной галереи.
У Кирстен есть младший брат Кристиан.
До девяти лет Кирстен вместе со своей семьей жила в Пойнт Плезант. После развода родителей Кирстен с матерью и братом переехали в Южную Калифорнию.
3 мая 2018 родила сына от своего жениха Джесси Племонса. Мальчика назвали Эннис Говард Племонс.