Роль второго плана в «Путешествие» (1997) свела его с будущей женой, актрисой Керри Престон, известной благодаря «Самозванцы» и «Играя Сердцем».
Майкл имеет степень Магистра Изящных Искусств по программе Фестиваля Шекспира в Алабаме (Alabama Shakespeare Festival).
Эмерсон отклонил предложение принять участие в нашумевшем фильме Майкла Бэя «Армагеддон» (1998).
Роль загадочного Генри Гейла в сериале «Остаться в Живых» планировалась лишь на три эпизода, однако игра Эмерсона настолько впечатлила продюсеров, что его ввели в группу основных персонажей. Так, к концу сериала невзрачный Генри Гейл перевоплотился в манипулятора и лидера «Других» — Бенджамина Лайнуса.
Некоторое время подрабатывал то здесь, то там и, в конечном счете, стал внештатным иллюстратором в одном из Нью-Йоркских журналов.