Нэйт родился в еврейской семье в Ориндже (Калифорния) и вырос в пригороде Миннеаполиса (Миннесота), его мама — дизайнер Нэнси Голден (Nancy Golden), у него есть младший брат Джесси Беркус (Jesse Berkus).
В 1995 году Нэйт основал в Чикаго собственную дизайнерскую компанию «Nate Berkus Associates».
