Его отец — бухгалтер-финансовый менеджер, а мать — учительница.
Полное имя — Сэмюэл Джордж Клафлин (Samuel George Claflin).
Сэм окончил среднюю школу Costessey High School в Костесси (Норфолк), старшую школу City College Norwich в Норидже (Норфолк) и в 2009 году Лондонскую академию музыкального и драматического искусства в Лондоне, получив актерское образование.
У Сэма есть трое братьев: двое старших, Бенджамин Клафлин и Дэниел Клафлин, и один младший, Джо Клафлин.