Пробовался на роль Шурика в фильм «Наваждение» (1965).
Народный артист РCФСР (1991).
Окончил актерский (1964) и режиссерский (1971, мастерская С.Герасимова) факультеты Всесоюзного государственного института кинематографии.
Сын Сергея Никоненко и Екатерины Ворониной — Никанор Сергеевич Никоненко, актёр, режиссер.