Окончил с отличием Калифорнийский Университет, в котором изучал историю и английскую литературу, и получил диплом бакалавра.
Шон поправился на 30 фунтов (примерно 13,6 кг) для роли Сэма в фильме «Властелин колец: Братство кольца» (2001).
После фильма «Властелин колец: Братство кольца» (2001) восемь из девяти членов Братства сделали себе татуировку в виде эльфийского символа «9». У Эстина татуировка находится на лодыжке.
Претендовал на режиссерское кресло фильма «Фантастическая четверка» (2005) в равной мере с Крисом Коламбусом, Пейтоном Ридом и Стивеном Содербергом.
Родился в семье актрисы Патти Дьюк и писателя Майкла Телла. Когда его мать вышла замуж во второй раз, его усыновил актер Джон Эстин.