В 2016 году у Уэса Андерсона и Джуман Малуф родилась дочь Фрея.
Его отец, Мелвер Леонард Андерсон, работал в рекламном бизнесе, в настоящее время имеет фирму по связям с общественностью в Хьюстоне. Его мать, Тексис Энн Берроуз, в прошлом археолог, работает агентом по недвижимости.
Полное имя — Уэсли Мортимер Уэльс «Уэс» Андерсон (Wesley Mortimer Wales «Wes» Anderson).
Уэс — второй из трех детей в семье.
Уэс изучал философию в Техасском университете.