Конец XX века. Несколько лет назад, ещё девочкой, сэр Интегра Хеллсинг получила в наследство от отца руководство секретной организацией «Хеллсинг», которая уже больше ста лет защищает Британию от нежити, и стала госпожой укрощённого супервампира Алукарда. После очередной зачистки Интегра замечает, что случаи спонтанного возникновения вампиров и созданных ими зомби заметно участились, когда в противостояние с «Хеллсингом» вступает 13-й отдел Ватикана «Искариот», состоящий из боевых магов под руководством паладина Александра Андерсона, и тайная организация «Миллениум».
Со времен легендарного охотника на вампиров, профессора Ван Хелсинга, тайная организация Королевских Протестантских Рыцарей, унаследовавшая имя своего основателя — «Хеллсинг», успешно сражается с вампирами, оборотнями и прочей нечистью, на берегах туманного Альбиона. Сейчас во главе организации стоит хладнокровная Интегра, правнучка Ван Хелсинга.
Именно ей предстоит вести настоящую войну с порождениями загадочных врагов человечества, превращающих людей в «искусственных упырей». Эпидемия распространяется с ужасающей скоростью и начинает угрожать существованию самой организации Королевских Протестантских Рыцарей. В час, когда отступают отряды элитного спецназа «Хеллсинга», единственной надеждой Интегры остается могущественный истинный вампир Алукард, вынужденный служить своим новым хозяевам — людям.
