Механик Джим Престон просыпается в капсуле гибернации космического корабля, который летит на Обитель, новую родину человечества. Его радостно приветствуют голограммы и роботы, но проблема в том, что из-за сбоя Джим проснулся один, а до пункта назначения лететь ещё 90 лет. Не имея возможности уснуть, он пытается развлекаться и напиваться, а через год решается на отчаянный поступок — разбудить ещё одного человека, писательницу Аврору.
Контракт Сэма подходит к концу: он провел три года на Луне, следя за автоматизированной станцией по добыче редкого газа. Три долгих года в полном одиночестве, если не считать говорящего робота ГЕРТИ, могут изменить любого. За две недели до возвращения на Землю Сэм встречает сменщика.
Доктор Райан Стоун, блестящий специалист в области медицинского инжиниринга, отправляется в свою первую космическую миссию под командованием ветерана астронавтики Мэтта Ковальски, для которого этот полет — последний перед отставкой. Но во время, казалось бы, рутинной работы за бортом случается катастрофа.
Шаттл уничтожен, а Стоун и Ковальски остаются совершенно одни; они находятся в связке друг с другом, и все, что они могут, — это двигаться по орбите в абсолютно черном пространстве без всякой связи с Землей и какой-либо надежды на спасение.
2006 год. Пол Конрой работает наёмным водителем в Ираке. Однажды во время засады он теряет сознание и спустя время приходит в себя в странном тесном тёмном месте. Воспользовавшись зажигалкой, Пол обнаруживает себя похороненным в гробу. Ему предстоит пережить много страшных и тяжелых мгновений борьбы за собственную жизнь в попытках выбраться из неожиданной ловушки.
В безднах космоса движется звездолет. Два члена команды, пробудившиеся от гиперсна, оказываются в сложной ситуации: оборудование не работает, вспомнить они ничего не могут. Какова была их миссия? Сколько времени прошло? Где они? Кто они? На все эти вопросы у них нет ответов. К тому же, на корабле обнаруживаются чужие — злобные воины, которые крушат все на своем пути.
У космических путешественников очень мало времени. Теперь для них собственные жизни — не самое главное, ибо только от них двоих, возможно, зависит спасение человечества. Нужно любой ценой восстановить управление кораблем, пока загадочный Пандорум не взял власть в свои руки.
