Косатка, или как ещё называют это огромное морское животное, кит-убийца, был разлучен со своей семьей. Люди доставили его в парк развлечений, дали имя Вилли и ожидали, что смогут заработать на его представлениях кучу денег.
В то же время зритель знакомится с мальчишкой Джесси, сбежавшим из дома и добывающим хлеб воровством и попрошайничеством. Джесси находит новых, добрых родителей и ему нужно стереть всякие не очень приличные надписи, которые он нарисовал спреем в парке. Там-то и случится встреча трудного подростка и кита-убийцы, и они полюбят друг друга с первого взгляда.
Однажды китобой, занимющийся незаконным промыслом, решает взять с собой в море малолетнего сына, чтобы научить его `искусству` убивать китов. Но судьба распорядилась иначе — он сам становится объектом охоты кита-убийцы. Лишь дружба мальчика с косаткой спасает китобоя от неминуемой гибели.
Слоган: The adventure is back. The fun is back. Willy's back. And this time he's brought his whole family to meet an old friend … and take on a new challenge.
Прошло два года с тех пор, как Вилли был выпущен на волю. Во время каникул Джесси с родителями отправляется на побережье, где люди часто видели одинокую косатку. Встреча старых друзей была радостной, но, к сожалению, недолгой: старый танкер сел на мель, и нефть, вытекающая из судна, поставила под угрозу жизнь Вилли и всех остальных обитателей океана.
