В 1598 году группа голландских кораблей выходит в море, чтобы грабить недавно открытые испанские и португальские владения в Новом Свете. Спустя почти 2 года плавания от экспедиции остаётся лишь одно судно «Эразм» с 28 моряками, которым управляет английский штурман Джон Блэкторн. Попав в сильнейший шторм, корабль терпит крушение у берегов Японии, а Блэкторн и его команда, ложно обвинённые местным португальским священником-иезуитом в пиратстве, оказываются в плену у самураев. Но судьба даёт Джону второй шанс. Его освобождают и отправляют в Осаку, поскольку с ним хочет познакомиться влиятельный даймё Ёси Торонага.
Действие разворачивается в Японии 70-х годов девятнадцатого века. Капитан Нейтон Альгрен, уважаемый американский военный офицер, нанят Императором Японии для обучения первой армии Страны Восходящего Солнца современному искусству ведения боевых действий.
Император пытается искоренить древних воинов-самураев, готовясь к более прозападной политике правительства…